美军对日本本土的无差别攻击在日本引起了恐慌，即便是用刺刀押着工人进入工厂，还是每天有大量的人携家拖口逃亡乡村和山中，东京、大阪、名古屋这样的大城市都遭到了毁灭性的打击，烧得变形碳化的尸体到处都是，散发着焦臭异味，富士山顶的白雪也被现代化的武器所污染变成了黑色，整个大和民族遭到了空前的灾难。
就在一个月前还在载歌载舞庆祝太平洋战场的巨大胜利的日本人此刻大多变成了亡魂，几十万被烧伤的患者缺少医药，每天都有大量的人死亡，伤者的呻吟和嚎叫声让人毛骨悚然。
个子不高的裕仁天皇在北海道的秘密行宫安顿了下来，回想起来还真是心惊胆颤的惊魂夜，皇宫被焚毁一空不说，留守的文官侍从全面毙命的消息对裕仁天皇打击颇大，如果真的当时坚持不走，恐怕现在也化为焦炭了，美国人这是要灭亡整个大和民族啊！这是进行另外一种的灭绝式的屠杀，现在国内的粮食储备早已告急，每天饿死人的消息已经让裕仁天皇麻木不堪，加之东京、大阪、名古屋几大城市变成废城和死城，整个日本都陷入了无限的恐慌之中，似乎现在的日本没有一个地方是安全的。
就在当晚，美国人轰炸了熊本、六本木、仙台三个名不见经传的地方，尤其居民不足三十万的熊本死伤超过二十万人，毫无防备的居民加上进城避难逃荒的亲属被直接全部烧死在睡梦中，裕仁天皇不明白美国人为何要轰炸那些小地方？难道就纯粹是为了杀人而杀人吗？
裕仁天皇哪里知道，轰炸熊本、六本木、仙台的情报是高飞提供给寇缔斯?李梅，军统给高飞伪造了一份假的情报，显示来自关东军的秘密资料，日本人在以上三地建有秘密设施，训练秘密部队，于是寇缔斯?李梅就直接实施了大规模的轰炸。
帝国绝对安全的领空一夜之间被戳穿了？如同妓女最后一块遮羞布一般被撕掉？暴怒的裕仁天皇将东条英机和山本五十六等人全部招致秘密行宫，他想知道这到底是怎么一回事？关东军的参谋长石原莞尔声称海军联合舰队主力全军覆没，但是海军阴谋欺骗国民与御前会议，海军指责陆军丢掉了整个中国战区和满蒙，面临绝境的关东军随时可能全军覆没。
海军与陆军相互之间的指责让裕仁天皇万分恼火，似乎所有的人看待他都如同看待一头傻驴一般？任意的隐瞒欺骗？堂堂的大日本帝国到底怎么了？为何会在一夜之间，一切全部崩坍？受到惊吓，极度疲倦的裕仁天皇有太多太多的问题了。
实际上，这已经是二个月之中，山本五十六第二次被召回本土了，第一次是庆祝太平洋海军之辉煌胜利，山本五十六所忧虑的是海军方面执意隐瞒战报，对于日本人来说，海军如果与美国人形成了拼消耗的局面，那就等同于输掉了战争，而且经过一年多的全国战时调动和总动员，美国巨大的战争实力迅速彰显出来。
太平洋大海战一役，由斯普雷恩斯少将和弗莱彻中将率领的第十六、第十六特混舰队一举歼灭了日本四艘大型航空母舰，将数百名训练有素的日舰机飞行员葬送海底，自此，日本海军仅仅维持了六个月的辉煌，便开始失去了制海权和制空权。
接下来的萨沃湾海海战、所罗门海战、瓜达尔失纳尔海战以及马里亚纳大海战中，日本联合舰队一败涂地，一艘艘航空母舰、战舰被美军轰炸机炸沉或重创，日本联合舰军队损失了三分之二的大型航空母舰和二千名训练有素的舰机飞行员，这个巨大的损失这不是三五年就能填补的，更为主要的是美国人在太平洋上已经跃跃欲试，似乎又在准备新的全面攻势。
山本五十六不是东条英机那样的精神万能主义者，日本在太平洋战争中从战略主动转变成战略被动，实际上并不是偶然的，除了美国强大的军工实力外，最为最要的还是其科技研发能力远远胜过日本，日本虽早在明治维新就己挤进世界列强之中，但在科学研究发展方面上却是一个不折不扣的瘸子，日本人在科学创新研究方面并无什么重大的发明或发现。
其近代的崛起强大是靠着一味的摸仿、抄袭、借鉴得来的，日本人本身并无自主创新，所以比起落后的农业国家来起来似乎很强大，但与世界真正强国如美国较量时，这一弱点便彰显岀来，因为日本不但无法从美国在获得贷款购买急需的废钢铁、航空发动机、橡胶、石油和最新的科技装备，得不到这些原型机，就意味着日本人需要投入从前未有的投资去进行研发，而已经习惯了剽窃的日本人缺乏科研实力，导致武器装备落后与美国。
山本五十六是日本帝国海军中保持清醒头脑的为数不多的几个人，他早就意识到了日本联合舰队的防空火力十分薄弱的问题，航空母舰很容易被美军轰炸机突袭轰炸，一旦巨大的航母遭到轰炸机和鱼雷机的袭击，后果则是毁灭性的。
山本五十六认为这是日本工业基础与美国军工科技巨大差异造成的，日本海军的舰载机零式战斗机以轻快灵活著称，在战争初期击确实落了大量美军飞机，但这种飞机装备轻薄，防护性差，驾驶舱和发动机未有任何防护措施，飞机一旦被击中，发动机就会泄油甚至起火爆炸，造成机毁人亡，而美国战机不但在飞机座舱装了甲，充分保护了机内人员，发动机和油箱也增加了钢板的厚度，并且油箱钢板外还罩了一层厚厚的橡胶，一旦油箱被弹片击穿，橡胶会融化堵住弹孔，以免飞机泄油，引起着火爆炸，另外美国战机装配了涡轮增压技术，使美机爬升得更高，可隐藏于高空云层中对日舰实施突然打击！
这是国家工业、科技实力的巨大差距，是战术根本无法拉近实现的。
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